PXI与PXIe机箱的差异在实际应用中，很多用户出现PXI板卡在同一PXI机箱不同槽位或者PXIe机箱中出现不识别、不受控制的情况，这种情况有可能是驱动程序没安装或者运行失败、控制器出现故障，但是不要忽略一个*基本的可能原因——机箱的某槽位不支持此板卡。PXI与PXIe机箱在背板和槽位上有些需要用户注意的关键点：总线结构PXI机箱—背板使用PCI的多点并行总线结构。PXIe机箱—背板使用PCIe的点对点串行总线结构。串行总线与比并行总线相比，PXIE-8840价格，串行总线的数据传输速率更快、扩展性更好、保真性更高。
PXI机箱—星形触发控制器槽可作为外设槽。PXIe机箱—定时槽仅可作为定时槽，回收PXIE-8840，不可作为外设槽。安装板卡时，注意匹配的槽位。系统槽PXI机箱—此槽适用PXI控制器。PXIe机箱—此槽仅使用PXIe控制器，威海PXIE-8840，并不适用PXI控制器。PCI桥的说明：PCI桥对于PXI机箱的用户是透明的，但是如果两个模块要通过触发总线传送触发信号时存在额外的困难点，因为触发总线不能直接穿过PCI桥。星形触发可以通过线路穿过PCI桥但是是连接数量受限。注意：用户需要确定模块板卡是不是需要使用触发功能、触发信号是否需要穿过PCI桥、是否有星形触发控制器。
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